科學研究表明，水華現(xiàn)象發(fā)生時，該水域多為干旱少雨，天氣悶熱，水溫偏高，風力較弱或者潮流緩慢等水域環(huán)境。也就是說，水華與當?shù)氐乃h(huán)境生態(tài)有密切的關(guān)系。水華爆發(fā)的因素主要有自然因素和人為因素。自然因素包括光照、水溫、水動力、營養(yǎng)鹽等；人為因素包括人為富營養(yǎng)化、大型水利工程等。

1、 溫度

20—30℃是水華現(xiàn)象發(fā)生的適宜溫度范圍。溫度升高，極端天氣增多會加劇藍藻水華。

不同的溫度對應的優(yōu)勢屬藻類也不同。其中20度以下主要為長孢藻，束絲藻；26度以下主要為水華微囊藻；26度以上主要為銅綠微囊藻；更高溫度有惠氏微囊藻。

2、 光照

白天藻類生物量**高于夜間。微囊藻白天細胞分裂頻率也高于夜間。

3、 營養(yǎng)鹽

水中總氮、總磷的濃度也決定了水華的爆發(fā)程度。氮磷的含量直接影響藻類的增殖速度。水華群體細胞數(shù)會隨著營養(yǎng)鹽濃度的增加而逐漸增大。當營養(yǎng)鹽類含量急劇上升，硅藻會大量繁殖，硅藻過盛常常引起水華現(xiàn)象。這些硅藻為夜光藻提供了豐富的餌料，促使夜光藻急劇增殖，還形成粉紅色的夜光藻水華現(xiàn)象。目前藍藻爆發(fā)主要原因是人為富營養(yǎng)化造成的。隨著人類對環(huán)境資源的開發(fā)利用活動日益增加，工業(yè)快速的發(fā)展，大量含有污染物的工業(yè)廢水和生活污水排入水體，使水體中氨氮、磷以及有機污染物等耗氧物質(zhì)濃度升高，從而增加了水中的營養(yǎng)物質(zhì)的負荷量。

4、 水動力

靜風條件有利于藻類生長甚至水華形成。臺風過后次月，營養(yǎng)鹽的濃度高，水華現(xiàn)象會嚴重。

5、 大型水利工程。

水利工程會導致不同程度的水溫變化，從而改變河段的徑流過程，直接影響下游水體系數(shù)、自凈能力和泥沙吸附能力，由此引起的水環(huán)境變化會進一步影響藻類的分布和生長。。

探索水華的成因，需要動態(tài)關(guān)注各種因素的影響，在研究水華爆發(fā)的現(xiàn)象時，不能**局限于夏季藍藻水華發(fā)生時環(huán)境特征的研究與觀察，還應提前關(guān)注藍藻的越冬生理生態(tài)特征、生存對策、藍藻群體形成的的條件，在春夏復蘇的觸發(fā)條件及生態(tài)閾值等等，這樣才能更好預測、預警水華的發(fā)生。